Linux（Ubuntu）上FastQC与MultiQC的安装与使用
# 更新Ubuntu软件包索引
sudo apt-get update
# 安装FastQC
sudo apt-get install fastqc
# 下载测试数据
wget -O SRR003161.fastq https://sra-downloadb.be-md.org/downloads/SRA100/SRA100121/SRA100121.fastq.gz
gunzip SRR003161.fastq.gz
# 使用FastQC分析数据
fastqc SRR003161.fastq
# 安装MultiQC
sudo apt-get install multiqc
# 使用MultiQC合并之前生成的FastQC报告
multiqc .这段代码展示了如何在Ubuntu系统上安装FastQC和MultiQC，并使用它们来分析一个测试的FASTQ文件。首先，更新软件包索引，然后安装FastQC。随后，使用wget下载示例数据并解压缩。接下来，使用FastQC生成报告。随后安装MultiQC，并使用MultiQC合并FastQC的报告。这个过程是数据分析的常规步骤，对于学习和理解FastQC和MultiQC的使用非常有帮助。
评论已关闭