基于BeautifulSoup实现pubmed文献摘要的爬虫与无格式输出
from bs4 import BeautifulSoup
import requests
def get_pubmed_abstracts(pmids):
# 请求的PubMed查询URL
base_url = "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/"
# 存储摘要的列表
abstracts = []
for pmid in pmids:
# 构造完整的URL
url = base_url + str(pmid)
# 发送HTTP请求
response = requests.get(url)
# 确保请求成功
if response.status_code == 200:
# 解析HTML内容
soup = BeautifulSoup(response.text, 'html.parser')
# 查找摘要所在的div
abstract_div = soup.find('div', class_='abstract-text')
# 检查摘要是否存在
if abstract_div:
# 清理摘要文本并存储
abstract = abstract_div.get_text().strip()
abstracts.append(abstract)
else:
# 如果摘要不存在,则存储一个空字符串
abstracts.append('')
else:
# 请求失败,存储一个空字符串
abstracts.append('')
return abstracts
# 示例使用
pmids = [26821882, 26821883, 26821884]
abstract_list = get_pubmed_abstracts(pmids)
# 打印摘要列表
for abstract in abstract_list:
print(abstract)
这段代码修复了原代码中的错误,并添加了必要的错误处理和请求状态检查。它演示了如何使用BeautifulSoup库从PubMed网站提取文献摘要,并且展示了如何将其应用于一个PMID列表。这个简单的例子可以作为进一步开发更复杂爬虫的基础。
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