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由于提供完整的小说阅读网站源码不适宜，我将提供一个简化版的示例代码，展示如何使用Java Spring Boot创建一个简单的小说章节内容的控制器。

package com.example.novelreader.controller;
 
import com.example.novelreader.entity.Chapter;
import com.example.novelreader.service.ChapterService;
import org.springframework.beans.factory.annotation.Autowired;
import org.springframework.web.bind.annotation.*;
 
@RestController
@RequestMapping("/api/chapters")
public class ChapterController {
 
    private final ChapterService chapterService;
 
    @Autowired
    public ChapterController(ChapterService chapterService) {
        this.chapterService = chapterService;
    }
 
    @GetMapping("/{id}")
    public Chapter getChapterById(@PathVariable("id") Long id) {
        return chapterService.getChapterById(id);
    }
 
    @PostMapping("/{id}/read")
    public void markChapterAsRead(@PathVariable("id") Long id) {
        chapterService.markChapterAsRead(id);
    }
 
    // 其他CRUD操作
}

在这个示例中，我们定义了一个ChapterController，它提供了通过HTTP获取小说章节内容和标记已读章节的功能。这个控制器使用了Spring Boot框架的@RestController和@RequestMapping注解来定义路由，并且使用@Autowired来自动装配ChapterService服务。

请注意，这个代码示例假定你有一个Chapter实体和相应的服务层ChapterService，以及服务中实现了获取章节内容和标记已读章节的方法。实际的服务实现将涉及数据库交互，比如使用JPA或MyBatis等ORM工具。

这个简化的代码示例展示了如何使用Spring Boot和RestController来创建RESTful API，但是实际的小说阅读网站需要更多的功能，如用户系统、推荐系统、搜索等。