批量将GOID转成GO term名并添加BP，MF，CC分类信息

为了解决这个问题，我们需要使用Gene Ontology编程接口（API）来查询GOID对应的GO term以及分类信息。以下是一个Python代码示例，使用了pyobo库来获取GOID对应的GO term以及分类信息。

首先，安装pyobo库（如果尚未安装）：

pip install pyobo

然后，使用以下Python代码批量获取GOID对应的GO term以及分类信息：

import pyobo
 
def get_go_terms(go_ids):
    results = []
    for go_id in go_ids:
        go_term = pyobo.go.get_go_id(go_id)
        if go_term:
            results.append({
                'GOID': go_id,
                'GO Term': str(go_term.name),
                'BP': 'Biological Process' in go_term.namespace,
                'MF': 'Molecular Function' in go_term.namespace,
                'CC': 'Cellular Component' in go_term.namespace,
            })
        else:
            results.append({
                'GOID': go_id,
                'GO Term': 'N/A',
                'BP': False,
                'MF': False,
                'CC': False,
            })
    return results
 
# 示例使用
go_ids = ['GO:0007594', 'GO:0000001', 'GO:9999999']  # 假设的GOID列表
go_terms = get_go_terms(go_ids)
 
# 打印结果
for term in go_terms:
    print(term)

这段代码定义了一个get_go_terms函数，它接受一个GOID列表，并返回一个包含每个GOID对应的GO term以及分类信息的字典列表。如果GOID有效，它将返回对应的GO term以及该term所属的BP, MF和CC的布尔值；如果GOID无效，则返回'N/A'和对应的False值。

请注意，这个示例假设了go_ids是一个有效的GOID列表。在实际应用中，你需要替换这个列表为你的目标GOID列表。此外，pyobo库会定期更新，因此确保你安装的版本是最新的，以获得最新的Gene Ontology数据。